Patrí medzi najskúsenejších zamestnancov NKÚ SR. V minulosti pôsobila ako generálna riaditeľka sekcie kontroly.

Aktuálne má Mária Kysucká na starosti projekt "Budovanie a rozvoj odborných kapacít za účelom zvyšovania kvality kontrolnej činnosti NKÚ SR", kde zastáva funkciu predsedníčky Riadiaceho výboru a využíva tak vedomosti zo vzdelávacích projektov, ktorými úrad prechádzal v minulosti.