Podľa zákona o dotáciách v rezorte obrany, ktorý platil počas rokov 2022 až 2024, neúplné žiadosti nemali byť posudzované. Ale nižšia norma, výnos o komisie, umožňoval tajomníkovi komisie vyzvať žiadateľa na doplnenie žiadosti. „Takýto postup bol v rozpore so zákonom a tento rozpor bol odstránený až v priebehu výkonu kontroly NKÚ SR, a to novelizáciou zákona o dotáciách, ktorá bola schválená Národnou radou SR v máji tohto roka,“ uviedol podpredseda úradu Jaroslav Ivančo. Na rozpor pritom upozorňovala aj sekcia legislatívy a práva MO SR. Kontrolóri na preverovanej vzorke zistili, že niektorí žiadatelia, ktorí boli vyzvaní na odstránenie nedostatkov tak neurobili, no napriek tomu boli ich žiadosti predložené komisii na posúdenie. Z kontrolovanej vzorky dotácií tak bolo 99 000 eur pridelených v rozpore so zákonom o dotáciách, čím došlo k porušeniu finančnej disciplíny podľa zákona o rozpočtových pravidlách.

Povinnosťou žiadateľov bolo predložiť žiadosť aj bez identifikácie. Kontrolóri si všimli, že v niektorých anonymizovaných žiadostiach ministerstvo upravilo štruktúru textu v časti stručný popis aktivít či členenie jednotlivých položiek rozpočtu. Výnos ministerstva neurčoval, koľko dní pred zasadnutím má tajomník doručiť predsedovi a členom komisie žiadosti. Kontrolóri zistili, že žiadosti na posúdenie boli predkladané členom komisie až v deň zasadnutia, pričom na zasadnutí v priemere posudzovali 174 žiadostí. „Ak členovia komisie videli žiadosti až v deň zasadnutia, nemali vytvorené podmienky na ich objektívne a spoľahlivé posúdenie,“ zdôraznil ďalej podpredseda. Chyby boli aj pri zverejňovaní výsledkov, neboli zverejnené výsledky alebo dátum, kedy došlo k neschváleniu žiadosti či nebol uvedený dôvod neschválenia. „Zistené a opakujúce sa chyby znižujú dôveryhodnosť systému prideľovania dotácií a otvárajú otázky o jeho transparentnosti,“ dodal podpredseda národných kontrolórov J. Ivančo. V troch kontrolovaných rokoch nebola realizovaná ani jedna kontrola použitia dotácie priamo u prijímateľov. Útvar vnútorného auditu MO SR žiaden vnútorný audit v tejto oblasti neurobil a to aj pre personálnu poddimenzovať tohto útvaru. 

Vnútorný kontrolný systém musí byť neoddeliteľnou súčasťou správy a riadenia verejných inštitúcií. „Je kľúčovým nástrojom na zabezpečenie plnenia cieľov a efektívneho a účelného využívania verejných financií,“ zdôraznil J. Ivančo. Pri dostatočne účinnom vnútornom kontrolnom systéme na ministerstve obrany by sa chyby pri poskytovaní a vyúčtovávaní dotácií neopakovali.